Posizione: Professore Associato
ISTRUZIONE/FORMAZIONE (Istituzione e Sede; Titolo di studio; Data di conseguimento; Ambito di studio)
Università di “Tor Vergata” (UNITV), Roma, Italia; Professore Associato;2022-presente;MicrobiologiaUniversità di “Tor Vergata” (UNITV), Roma, Italia;RTD-B;2019-2022;Microbiologia Università di Siena/Università di Firenze, Italia;post-doc;2006-2019;Microbiologia clinica Università di Siena (UNISI), Siena, Italia;Dottorato di ricerca(Biotecnologie Mediche);12/2005;Genotipizzazione di beta-lattamasi con DNA Microarrays Università di Siena, Siena, Italia;Master;07/2001;Chimica e tecnologia farmaceutiche
DICHIARAZIONE PERSONALE
La mia attività di ricerca riguarda, o ha interessato, principalmente le seguenti linee di ricerca: 1. Sviluppo di plasmidi di Escherichia coli per l'espressione eterologa di anticorpi Fab di derivazione umana2. Studio dei meccanismi di resistenza agli antibiotici dei batteri patogeni e dei meccanismi genetici alla base della loro diffusione 3. Sviluppo di DNA chips e DNA microarrays per la genotipizzazione di geni di resistenza agli antibiotici 4. Caratterizzazione epidemiologica e genetica di collezioni di ceppi batterici antibiotico-resistenti di origine nosocomiale, con particolare attenzione ai cloni emergenti multiresistenti o ai fenotipi emergenti di antibiotico-resistenza 5. Ricerca e caratterizzazione di batteriofagi di potenziale interesse per l'utilizzo in campo biotecnologico e medico.
POSIZIONI E OCCUPAZIONE 2022-presente Professore Associato di Microbiologia, UNITV, Roma, Italia. 2019 – 2022 Assistant Professor di Microbiologia, UNITV, Roma, Italia. 2017-2019 Visiting Professor, corso di “Genomica e Bioinformatica dei Microrganismi”, Corso di Laurea Magistrale in Bioinformatica, UNITV, Roma, Italia. 2017-2018 Assegnista di ricerca in Microbiologia Clinica (UNISI, Siena, Italia). 2016-2017 Assegnista di ricerca in Microbiologia Clinica (Università di Firenze, Firenze, Italia). 2015-2019 Visiting Professor, corso di “Bioinformatica in Microbiologia Clinica”, Corso Integrato di “Microbiologia Clinica”, Master in Biotecnologie Mediche.UNISI,Siena, Italia. 2012-2014 Visiting Professor, corso di “Microbiologia”, Corso Integrato di “Microbiologia”.UNISI, Siena, Italia. 2012-2016 Assegnista di ricerca in Microbiologia Clinica (UNISI, Siena, Italia). 2009-2011 Professore a contratto, modulo di “Laboratorio di Bioinformatica”, Corso integrato di “Biotecnologie della Salute Umana”, Corso di Laurea in Biotecnologie.UNISI, Siena, Italia. 2007-2009 Professore a contratto, modulo dell'“Informatica”, Corso Integrato di “Matematica, Statistica e Informatica”, Corso di Laurea Interfacoltà in Biotecnologie.UNISI, Siena, Italia. 2007-2008 Professore a contratto, modulo di “Bioinformatica”, Corso Integrato di “Biochimica Molecolare”, Corso di Laurea Interfacoltà in Biotecnologie.UNISI, Siena, Italia. ALTRE ESPERIENZE 2020 Guest Editor del numero speciale “Batteriofagi e loro componenti come strumenti promettenti e alternativi per il controllo degli agenti patogeni batterici”, Microrganismi, MDPI.2020 Co-Guest Editor del numero speciale intitolato “Antibiotici e resistenza agli antibiotici in ambienti acquatici”, Antibiotici, MDPI. 2020 Co-redattore ospite del numero speciale “Aggiornamenti su nuovi agenti antimicrobici e strategie contro i batteri patogeni, 2a edizione”, Antibiotici, MDPI. Dal 2020 ad oggi Membro del comitato editoriale di Microrganismi, MDPI Dal 2019 a oggi Membro del comitato editoriale di Antibiotics, MDPI2019 Guest Editor del numero speciale “Aggiornamenti su nuovi agenti antimicrobici e strategie contro i batteri patogeni”, Antibiotici, MDPI. Dal 2019 a oggi Review Editor per "Frontiers in Microbiology" e "Frontiers in Immunology", sezioni "Antimicrobials, Resistance and Chemotherapy" e "Microbial Immunology". 2016 Abilitazione Nazionale a Professore Associato di MICROBIOLOGIA (SSD BIO/19). 2002 Periodo di tirocinio per attività di ricerca presso l'“Institute of Food Research”, Norwich Research Park, Norwich (Regno Unito).Argomento: “Validazione di microarray dell'intero genoma per geneesperimenti di espressione in Streptococcus spp.”. PREMI Premio 2018 della Federation of European Microbiological Society (FEMS) per il poster "Tn6349: a novel cfr- and poxtA-carrying transposon of enterococccal origin in a linezolid resistenti MRSA",presentato al 46° congresso della Società Italiana di Microbiologia tenutosi a Palermo (26-29 settembre 2018). Premio EUROSCICON 2016 per la presentazione dei poster a “Bacteriophage 2016”.Poster "Caratterizzazione molecolare e fisiologica di un nuovo batteriofago litico contro KPC-positivoKlebsiella pneumoniae", presentato al congresso Bacteriophage 2016 tenutosi a Londra (19-21 gennaio 2016). Premio della Società Italiana di Microbiologia 2015 per il miglior poster della sessione “Batteriologia”.Poster "Risposta infiammatoria differenziale indotta dai due cladi della pandemia ST258 Klebsiellapneumoniae", presentato al 43° congresso dell'Università di Napoli (27-30 settembre 2015). Premio della Società Italiana di Microbiologia 2014 per la migliore comunicazione orale della sessione“Batteriologia-Micologia-Parassitologia”.Comunicazione “Caratterizzazione di batteriofagi ad attività litica per cloni maggiori di Klebsiella pneumoniae produttrice di KPC”, presentata al 42° congresso della Società Italiana di Microbiologia tenutosi a Torino (28 settembre - 1 ottobre 2014). CONTRIBUTI SCIENTIFICI La mia attività scientifica riguarda principalmente temi relativi ai meccanismi di resistenza agli antibiotici negli isolati nosocomiali, in particolare Klebsiella pneumoniae e altre Enterobacteriaceae, eallo studio dei batteriofagi come potenziali strumenti per limitare la diffusione e la patogenesi di batteri multiresistenti.
Dal 2013 applico tecniche di sequenziamento di nuova generazione e approcci di sequenziamento massivo per lo studio di elementi genetici mobili, per l'identificazione di nuovi determinanti di resistenza e per la caratterizzazione di diverse comunità microbiche e batteriofagi, utilizzando approcci di metagenomica e metatrascrittomica.
Sono coautore di 70 pubblicazioni scientifiche su riviste peer-reviewed, più di 100 poster e comunicazioni a convegni nazionali e internazionali, e inventore di un brevetto e di una famiglia di brevetti.
Scopus riporta 3268 citazioni di 2767 documenti e un valore h-index di 28 (all'11 aprile 2024).
Identificatori univoci dell'autore sulle piattaforme web:ID ORCID: 0000-0003-3187-3210 ID Scopus: 35331800300
Ho partecipato come relatore o relatore invitato a numerosi convegni scientifici in Italia e all'estero.
Svolgo attività di revisore per numerose riviste scientifiche internazionali, tra cui: Antibiotics, Applied and Environmental Microbiology, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, International Journal of Antimicrobial Agents and Chemotherapy, PLoS One, Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Scientific Reports, BMC Microbiology, Viruses, Microrganismi, Genome Medicine, Frontiers inMicrobiology ed EBioMedicin.
Co-inventore della domanda di brevetto "Batteriofago capace di lisare Klebsiella pneumoniae esprimente un polisaccaride capsulare CPSKKBO-4 e relativi usi medici" depositata in Italia il09/11/2015 n.102015000070435, ed ampliato con PCT pubblicata il 18/05/2017 n.WO2017081709.
Co-Inventore della domanda di brevetto “NOVEL SELECTION SYSTEM” depositata in EPO n. EP20050109274 del 06/10/2005 (brevetto concesso il 18/11/2015 n. EP1945772) ed esteso il 04/10/2006 n.WO2006EP67053, con applicazioni in fasi nazionali/regionali in diversi paesi.
Ho beneficiato dei seguenti fondi di ricerca ottenuti da enti nazionali ed internazionali, pubblici e privati, come di seguito dettagliato:
PROGETTI INTERNAZIONALI
2011-2015 - EU FP7 Evolution and Transfer of Antibiotic Resistance (EVOTAR), n° 282004.
2010-2013 - EU FP7 An Integrated Tool-Kit for the Clinical Evaluation of Microbial Detection and Antibiotic Susceptibility Point-of-Care Testing Technologies (TEMPOTEST-QC), n° 241742.
2009-2012 - EU FP7 Translation Research On Combating Antimicrobial Resistance (TROCAR), n° 223031.
PROGETTI NAZIONALI E FINANZIAMENTI DA PARTE DI IMPRESE PRIVATE
Per i primi tre dei seguenti progetti nazionali mi è stata delegata la responsabilità scientifica del progetto:2016 - Caratterizzazione della flora fungina indigena degli alimenti e caratterizzazione del potere antibatterico degli estratti grezzi di tali funghi.Committente: Progetto Alimenti s.r.l.– Arezzo (AR), Italia.2015 - Valutazione delle piastre cromatiche OXA-48.Azienda: Liofilchem s.r.l.Roseto degli Abruzzi (TE), Italia.
2010-2011 - Valutazione del prodotto MIC test strip nella determinazione delle concentrazioni minime inibenti. Commissionato da: Liofilchem s.r.l.- Roseto degli Abruzzi (TE), Italia.
2007-2009 - MIUR “Realizzazione di un laboratorio nazionale per lo studio della resistenza batterica agli antibiotici” (FIRB 2005).
SUPPORTO ALLA RICERCA NEGLI ULTIMI 10 ANNI
Ricerca commissionata (GSK Vaccines S.r.l): “Set-up di un modello sperimentale in Galleria mellonella per la valutazione dell'effetto protettivo dei sieri iperimmune verso l'infezione da Staphylococcus aureus” Ott 2020 – Dic 2021. Rinnovata. Dic 2021 - Dic 2022. Ruolo: PI.
Position: Associate Professor
EDUCATION/TRAINING (Institution and Location; Degree; Completion Date; Field of Study)
Univ of “Tor Vergata” (UNITV), Rome, Italy; Associate Professor; 2022-present; Microbiology
Univ of “Tor Vergata” (UNITV), Rome, Italy; RTD-B; 2019-2022; Microbiology
Univ of Siena/Univ of Florence, Italy; postdoc; 2006-2019; Clinical Microbiology
Univ of Siena (UNISI), Siena, Italy; Ph.D. (Medical Biotechnologies); 12/2005; Genotyping of beta-Lactamases with DNA Microarrays
Univ of Siena, Siena, Italy; Master Degree; 07/2001; Pharmaceutical chemistry and technology
PERSONAL STATEMENT
My research activity mainly concerns, or has concerned, the following research lines: 1. Development of Escherichia coli plasmids for the heterologous expression of human-derived Fab antibodies 2. Study of the antibiotic resistance mechanisms of pathogenic bacteria, and the genetic mechanisms at the basis of their spread
3. Development of DNA chips and DNA microarrays for the genotyping of antibiotic resistance genes
4. Characterization of the epidemiology and genetic of collections of antibiotic-resistant bacterial strains of nosocomial origin, with particular attention to emerging multi-drug resistant clones or emerging antibiotic resistance phenotypes
5. Research and characterization of bacteriophages of potential interest for the use in biotechnological and medical fields.
POSITIONS AND EMPLOYMENT
2022- present Associate Professor of Microbiology, UNITV, Rome, Italy.
2019 – 2022 Assistant Professor of Microbiology, UNITV, Rome, Italy.
2017-2019 Visiting Professor, course of “Genomics and Bioinformatics of Microorganisms”, Master's Degree Course in Bioinformatics, UNITV, Rome, Italy.
2017-2018 Research Fellow in Clinical Microbiology (UNISI, Siena, Italy).
2016-2017 Research Fellow in Clinical Microbiology (University of Firenze, Florence, Italy).
2015-2019 Visiting Professor, course of "Bioinformatics in Clinical Microbiology", Integrated Course of "Clinical Microbiology", Master's Deree course in Medical Biotechnology. UNISI,
Siena, Italy.
2012-2014 Visiting Professor, course of "Microbiology", Integrated Course of "Microbiology". UNISI, Siena, Italy.
2012-2016 Research Fellow in Clinical Microbiology (UNISI, Siena, Italy).
2009-2011 Adjunct Professor, module of “Bioinformatics Laboratory”, Integrated course of “Biotechnology of Human Health”, Degree course in Biotechnology. UNISI, Siena, Italy.
2007-2009 Adjunct Professor, module of the “Computer Science”, Integrated Course of “Mathematics, Statistics and Computer Sciences”, Degree Course Interfaculty In Biotechnology. UNISI, Siena, Italy.
2007-2008 Adjunct Professor, module of “Bioinformatics”, Integrated Course of “Molecular Biochemistry”, Degree Course Interfaculty in Biotechnology. UNISI, Siena, Italy.
OTHER SELECTED EXPERIENCES AND PROFESSIONAL MEMBERSHIPS
2020 Guest Editor of the Special Issue “Bacteriophages and Their Components as Promising and Alternative Tools for the Control of Bacterial Pathogens”, Microorganisms, MDPI.
2020 Co-Guest Editor of the Special Issue entitled “Antibiotics and Antibiotic Resistance in Aquatic Environments”, Antibiotics, MDPI.
2020 Co-Guest Editor of the Special Issue “Updates on Novel Antimicrobials Agents and Strategies against Pathogenic Bacteria, 2nd Edition”, Antibiotics, MDPI.
2020-present Member of the Editorial Board of Microorganisms, MDPI
2019-present Member of the Editorial Board of Antibiotics, MDPI
2019 Guest Editor of the Special Issue “Updates on Novel Antimicrobial Agents and Strategies Against Pathogenic Bacteria”, Antibiotics, MDPI.
2019-present Review Editor for "Frontiers in Microbiology” and “Frontiers in Immunology”, sections "Antimicrobials, Resistance and Chemotherapy” and “Microbial Immunology”.
2016 National Qualification as Associate Professor of MICROBIOLOGY (SSD BIO/19).
2002 Training period for research activities at the "Institute of Food Research", Norwich Research Park, Norwich (United Kingdom). Topic: “Validation of whole-genome microarrays for gene
expression experiments in Streptococcus spp.”.
HONORS
2018 Federation of European Microbiological Society (FEMS) award for the poster "Tn6349: a novel cfr- and poxtA-carrying transposon of enterococcal origin in a linezolid resistant MRSA",
presented at the 46rd congress of the Italian Society of Microbiology held in Palermo (26-29 September 2018).
2016 EUROSCICON award for the presentation of posters at “Bacteriophage 2016”. Poster "Molecular and physiological characterization of a new lytic bacteriophage against KPC-positive
Klebsiella pneumoniae", presented at the Bacteriophage 2016 congress held in London (19-21 January 2016).
2015 Italian Society of Microbiology award for best poster of the session “Bacteriology”. Poster "Differential inflammatory response induced by the two clades of the pandemic ST258 Klebsiella
pneumoniae", presented at the 43rd congress of the held in Naples (27-30 September 2015).
2014 Italian Society of Microbiology award for best oral communication of the session
“Bacteriology-Mycology-Parasitology”. Communication "Characterization of bacteriophages with lytic activity for major clones of KPC-producing Klebsiella pneumoniae", presented at the 42nd congress of the Italian Society of Microbiology held in Turin (28 September - 1 October 2014).
CONTRIBUTIONS TO SCIENCE
My scientific activity is mainly involved on issues related to the mechanisms of antibiotic resistance in nosocomial isolates, particularly on Klebsiella pneumoniae and other Enterobacteriaceae, and
on the study of bacteriophages as potential tools to limit the spread and pathogenesis of multidrug-resistant bacteria.
Since 2013 I have applied next generation sequencing techniques and massive sequencing approaches for the study of mobile genetic elements, for the identification of new resistance determinants and for the characterization of different microbial communities and bacteriophages, by using metagenomics and metatrascriptomics approaches.
I am the co-author of 70 scientific publications in peer-reviewed journals, more than 100 posters and communications at national and international conferences, and inventor of a patent and a patent family.
Scopus reports 3268 citations by 2767 documents and a h-index value of 28 (on April 11, 2024).
-Unique author identifiers on web platforms:
ORCID ID: 0000-0003-3187-3210
Scopus ID: 35331800300
I participated as a speaker or invited speaker at many scientific conferences in Italy and abroad.
I carry out referee activities for many international scientific journals, e.g.: Antibiotics, Applied and Environmental Microbiology, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, International Journal of Antimicrobial Agents and Chemotherapy, PLoS One, Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Scientific Reports, BMC Microbiology, Viruses, Microorganisms, Genome Medicine, Frontiers in
Microbiology and EBioMedicine.
Co-Inventor of the patent application "Bacteriophage capable of lysing Klebsiella pneumoniae expressing a capsular polysaccharide CPSKKBO-4 and its related medical uses" filed in Italy on
09/11/2015 n. 102015000070435, and extended with PCT published on 18/05/2017 n. WO2017081709.
Co-Inventor of the patent application “NOVEL SELECTION SYSTEM” deposited in EPO n. EP20050109274 on 2005/10/06 (patent granted on 2015/11/18 n. EP1945772) and extended
on 2006/10/04 n. WO2006EP67053, with applications in national/regional phases in several countries.
I have been supported by the following Research grants obtained by national and international, public and private, institutions, as detailed below:
INTERNATIONAL PROJECTS
2011-2015 - EU FP7 Evolution and Transfer of Antibiotic Resistance (EVOTAR), n ° 282004.
2010-2013 - EU FP7 An Integrated Tool-Kit for the Clinical Evaluation of Microbial Detection and Antibiotic Susceptibility Point-of-Care Testing Technologies (TEMPOTEST-QC), n ° 241742.
2009-2012 - EU FP7 Translation Research On Combating Antimicrobial Resistance (TROCAR), n° 223031.
NATIONAL PROJECTS AND FINANCING BY PRIVATE COMPANIES
For the first three of the following national projects, I have been delegated the scientific responsibility of the project:
2016 - Characterization of the indigenous fungal flora of foods and characterization of the antibacterial power of raw extracts from these fungi. Commissioned by: Progetto Alimenti s.r.l. – Arezzo (AR), Italy.
2015 - Evaluation of the Chromatic OXA-48 plates. Firm: Liofilchem s.r.l. Roseto degli Abruzzi (TE), Italy.
2010-2011 - Evaluation of the MIC test strips product in the determination of minimum inhibitory concentrations. Commissioned by: Liofilchem s.r.l. - Roseto degli Abruzzi (TE), Italy.
2007-2009 - MIUR "Construction of a national laboratory for the study of bacterial resistance to antibiotics" (FIRB 2005).
RESEARCH SUPPORT IN THE LAST 10 YEARS
Commissioned research (GSK Vaccines S.r.l): “Set-up of an experimental model in Galleria mellonella for the evaluation of the protective effect of iperimmune sera towards infection with Staphylococcus aureus” Oct 2020 – Dec 2021. Renewed. Dec 2021 - Dec 2022. Role: PI.